健康时报先后获得国家新闻出版广电总局（原新闻出版总署）、国家卫计委（原卫生部）、国家药监总局（原国家药监局）、中国健康传播大会（清华大学主办）、国家中医药管理局、中华医学会等社外各类奖项54次（项）。

            2003年至今，健康时报一直被全国人大、全国政协指定为“全国两会”上会报纸，供全国代表、委员阅读。在全国500家三甲医院驻有特约记者，30位医药卫生健康界的“两院”院士担任健康时报院士顾问团顾问，为报社发展提供智库支持，近1000位知名健康专家长期为本报撰稿。

            由健康时报发起主办的一年一度的“健康中国”盛典、“年度十大健康新闻”活动已成为业界的著名品牌，目前已举办了六届。

            2012年健康时报社与共青团北京市委联合推出“3510在行动·我是步行族”活动，由北京50家直属局委事业单位、近2000名公务员、300名全国人大代表政协委员、全国50所大学校长支持参与的每天一万步行动，获得很大的社会反响。

            健康时报建设学习型报社，组织清华大学公共健康中心硕士研究生课程、中国传媒大学健康传播硕士研究生课程公开课，报社多名员工在清华大学公共健康中心、中华医学会、中国心律不齐联盟、北京医学会急救分会等十余个机构担任职务。